Türkiye Cumhuriyeti (TC) ve Birleşmiş Milletler Çocuklara Yardım Fonu (UNICEF) işbirliği ile geliştirilip Avrupa Birliği’nin mali ve UNICEF’in teknik desteği ile 2008-2009 yıllarında gerçekleştirilen “Önce Çocuklar: Çocuk Koruma Mekanizmalarının İl Düzeyinde Modellenmesi Projesi” içerisinde alt projeleri, üniversite ve baro temsilcileri yürütmüşlerdir. Bu projelerden olan “üniversitelerde çocuk koruma merkezleri yapılandırılması” çalışmaları, “Üniversite Çocuk Koruma Uygulama ve Araştırma Merkezlerinin” kurulmasının önerilmesiyle sonuçlanmıştır.13 Merkez kurulması önerisi beklenenin üzerinde ilgi görmüş ve proje sonlanmadan ve proje sonlandıktan sonra bazı üniversitelerde çocukla ilgili uzmanlık dallarının bir araya geldiği bu merkezler peş peşe kurulmuştur. Ordu Üniversitesi Çocuk Koruma Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü ise 25 Kasım 2015 yılında kurulmuştur. Merkez Müdürlüğümüz bu tarihten itibaren faaliyetlerine devam etmektedir.